Tujuan Fakultas Kedokteran Hewan adalah :
- Menghasilkan lulusan di bidang kedokteran hewan yang profesional dan mampu bersaing di tingkat Nasional dan Internasional
- Menghasilkan karya penelitian di bidang kedokteran hewan yang dapat mendukung peningkatan kesejahteraan manusia melalui peningkatan kesehatan hewan dan lingkungan
- Menghasilkan karya pengabdian masyarakat yang dapat meningkatkan kesejahteraan masyarakat dalam mendukung pembangunan bangsa
- Menghasilkan kerjasama yang saling menguntungkan antar instansi terkait didalam dan diluar negeri untuk meningkatkan kualitas pendidikan, penelitian dan pengabdian masyarakat
Tujuan tersebut terkait dengan tugas teknis Dokter Hewan antara lain
a. Melakukan diagnosa, pencegahan, pengendalian, pemberantasan dan pengobatan penyakit menular pada hewan dan penyakit zoonosis secara komprehensif multidisipliner
b. Melestarikan dan memanfaatkan satwa untuk kesejahteraan manusia, kelestarian lingkungan dan plasma nutfah
c. Menjamin mutu dan pengamanan bahan pangan asal hewan serta bahan-bahan asal hewan dalam rangka menjaga kesehatan masyarakat madani melalui safety food
d. Mengawasi dan pengendali mutu, pemakaian, peredaran obat hewan dan bahan biologis
e. Meningkatkan mutu gizi protein hewani, kesehatan masyarakat dan kesehatan lingkungan
f. Penelitian dan pengembangan IPTEK kedokteran hewan