Tujuan Fakultas Kedokteran Hewan adalah :

a. Menghasilkan lulusan profesional veteriner medis Dokter Hewan sebagai klinikus untuk meningkatkan ketepatan keputusan dan tindakan medis mengacu pada Etika Medis serta kompetensi medik veteriner

b. Menghasilkan Dokter Hewan yang mampu menjawab tantangan agar terbangun masyarakat madani yang sehat jasmani maupun rokhani melalui kesehatan masyarakat veteriner

c. Menghasilkan Dokter Hewan yang berkemampuan sebagai peneliti, akademisi, manajerial dan berjiwa technopreunership

Tujuan tersebut terkait dengan tugas teknis Dokter Hewan antara lain

a. Melakukan diagnosa, pencegahan, pengendalian, pemberantasan dan pengobatan penyakit menular pada hewan dan penyakit zoonosis secara komprehensif multidisipliner

b. Melestarikan dan memanfaatkan satwa untuk kesejahteraan manusia, kelestarian lingkungan dan plasma nutfah

c. Menjamin mutu dan pengamanan bahan pangan asal hewan serta bahan-bahan asal hewan dalam rangka menjaga kesehatan masyarakat madani melalui safety food

d. Mengawasi dan pengendali mutu, pemakaian, peredaran obat hewan dan bahan biologis

e. Meningkatkan mutu gizi protein hewani, kesehatan masyarakat dan kesehatan lingkungan

f. Penelitian dan pengembangan IPTEK kedokteran hewan